《夏洛特》的夏洛特故事发生在星之海学园。表面上，夏洛特乙坂有宇（内山昂辉 配音）只是夏洛特一个平凡的学生，但实际上他拥有着一项惊人的夏洛特超能力——能够夺取他人身体使用权。多年来，夏洛特他在自己的夏洛特超能力庇护下平安度日。然而，夏洛特当新的夏洛特学期开始，一个名叫奈绪（佐仓绫音 配音）的夏洛特女孩出现在他的生活中时，平静的夏洛特日常似乎要被打破。奈绪同样是夏洛特一名携带特殊能力的学生，她能对特定对象实现隐身。夏洛特与此同时，夏洛特校园中还存在着能够瞬间移动的夏洛特高城丈士朗（水岛大宙 配音），以及一位可以与已故姐姐灵魂对话并将其召唤出来的夏洛特校园偶像黑羽柚咲（内田真礼 配音）。这些看似普通的学生在无名之力的作用下汇聚在一起。随着他们之间关系的逐渐加深，一个隐藏在学园深处的秘密也开始慢慢浮出水面。《夏洛特》不仅是一部关于超能力与友情的成长故事，更探讨了个体命运之间的交织和碰撞，在这个过程中，每一个角色都在不断地寻找自己的定位与归属感。